14/09, 10:05–10:45 (America/Sao_Paulo), Auditorio
Neste mini-cursom exploraremos a extração de resumos de artigos científicos a partir do PubMed (NCBI) utilizando-se a api E-utilities e na interação com a API GPT para formulação de perguntas.
Todo o pipeline será construindo em python com versionamento em git.
Este mini-curso de 30 minutos é uma jornada prática pela extração de resumos de artigos científicos, direto do PubMed (NCBI). Utilizaremos as poderosas ferramentas E-utilities para acessar e recuperar esses artigos de forma eficiente. Além disso, exploraremos a interação com a API GPT para formular perguntas relevantes com base nos conteúdos extraídos.
Construiremos todo o pipeline em Python, aproveitando ao máximo a flexibilidade e robustez dessa linguagem. O versionamento do código será feito utilizando Git, garantindo um ambiente de desenvolvimento organizado e colaborativo.
Esther Reis, doutora em Genética e física de formação, atua como fullstack e bioinformata na GNTech Exames. Em seu pos-doutorado na UNIFESP, contribui para o projeto "Aprendizagem de Máquina Causal para a Inferência de Fenótipos Farmacogenéticos", combinando sua expertise em genética e aprendizado de máquina para avançar na medicina personalizada.
Formado em Ciências Biológicas pela UFSC, atua na área de bioinformática com foco em farmacogenética. Trabalha como bioinformata e desenvolvedor back-end focado em softwares para análises de dados genômicos, com atuação em desenvolvimento utilizando Python.